Chemsketch..

Chemsketch

ChemSketch adalah software yang digunakan untuk mengambar dan memodelkan struktur kimia seperti software ChemOffice. Software ChemSketch dapat mengambar struktur kimia dalam bentuk 2D dan 3D. Software ini sangat mudah digunakan, hanya dengan mengklik dan mendrag tool-tool yang tersedia untuk mengambar struktur yang diinginkan. Program ini juga menyediakan struktur asam amino, alkaloid, karbohidrat, asam nukleat, DNA/RNA, lab kit (semua peralatan kimia berupa gelas), orbital, senyawa phospor, steroid, terpen, dll. Software ini juga menyediakan pengambaran kurva dan grafik. ChemSketch dikeluarkan oleh ACD/labs.com yang didownload secara gratis (freeware), bagi teman-teman yang suka, yang gratis-gratis silakan download software ini disini.., dijamin ngga bakal nyesal ???
Bagian terindah dalam mempelajari ilmu kimia adalah saat kita bisa mengamalkannya secara ikhlas, salah satu ilmu yang dapat mendekatkan kita dengan pencipta adalah ilmu kimia, asalkan kita dapat memahami dan mengamalkannya secara ikhlas. 

 

Sumber : http://networkedblogs.com/5Jxcw

opo iku autodock..?

AutoDock

What is AutoDock?

AutoDock is a suite of automated docking tools. It is designed to predict how small molecules, such as substrates or drug candidates, bind to a receptor of known 3D structure.

Current distributions of AutoDock consist of two generations of software: AutoDock 4 and AutoDock Vina.

AutoDock 4 actually consists of two main programs: autodock performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein; autogrid pre-calculates these grids.

In addition to using them for docking, the atomic affinity grids can be visualised. This can help, for example, to guide organic synthetic chemists design better binders.

AutoDock Vina does not require choosing atom types and pre-calculating grid maps for them. Instead, it calculates the grids internally, for the atom types that are needed, and it does this virtually instantly.

We have also developed a graphical user interface called AutoDockTools, or ADT for short, which amongst other things helps to set up which bonds will treated as rotatable in the ligand and to analyze dockings.

AutoDock has applications in: X-ray crystallography; structure-based drug design; lead optimization; virtual screening (HTS); combinatorial library design; protein-protein docking; chemical mechanism studies.

AutoDock 4 is free and is available under the GNU General Public License. AutoDock Vina is available under the Apache license, allowing commercial and non-commercial use and redistribution. Click on the "Downloads" tab. And Happy Docking!

What is AutoDock Vina?

AutoDock Vina is a new generation of docking software from the Molecular Graphics Lab. It achieves significant improvements in the average accuracy of the binding mode predictions, while also being up to two orders of magnitude faster than AutoDock 4.¹

Because the scoring functions used by AutoDock 4 and AutoDock Vina are different and inexact, on any given problem, either program may provide a better result.

Detailed information can be found on the AutoDock Vina web site.

What's new?

AutoDock 4.2 is faster than earlier versions, and it allows sidechains in the macromolecule to be flexible. As before, rigid docking is blindingly fast, and high-quality flexible docking can be done in around a minute. Up to 40,000 rigid dockings can be done in a day on one cpu.

AutoDock 4.2 now has a free-energy scoring function that is based on a linear regression analysis, the AMBER force field, and an even larger set of diverse protein-ligand complexes with known inhibition constants than we used in AutoDock 3.0. The best model was cross-validated with a separate set of HIV-1 protease complexes, and confirmed that the standard error is around 2.5 kcal/mol. This is enough to discriminate between leads with milli-, micro- and nano-molar inhibition constants.

You can read more about the new features in AutoDock 4.2 and how to use them in the AutoDock4.2 User Guide.

AutoDock 4 is Free Software

The introduction of AutoDock 4 comprises three major improvements:

1. The docking results are more accurate and reliable.
2. It can optionally model flexibility in the target macromolecule.
3. It enables AutoDock's use in evaluating protein-protein interactions.

AutoDock 4.0 not only is it faster than earlier versions, it allows sidechains in the macromolecule to be flexible. As before, rigid docking is blindingly fast, and high-quality flexible docking can be done in around a minute. Up to 40,000 rigid dockings can be done in a day on one cpu.

AutoDock 4.0 now has a free-energy scoring function that is based on a linear regression analysis, the AMBER force field, and an even larger set of diverse protein-ligand complexes with known inhibiton constants than we used in AutoDock 3.0. The best model was cross-validated with a separate set of HIV-1 protease complexes, and confirmed that the standard error is around 2.5 kcal/mol. This is enough to discriminate between leads with milli-, micro- and nano-molar inhibition constants.

You can read more details about the new features in AutoDock4.2 User Guide.

AutoDock 4.0 can be compiled to take advantiage of new search methods from the optimization library, ACRO, developed by William E. Hart at Sandia National Labs. We have also added some new features to our existing evolutionary methods. We still provide the Monte Carlo simulated annealing (SA) method of 2.4 and earlier. The Lamarckian Genetic Algorithm (LGA) is a big improvement on the Genetic Algorithm, and both genetic methods are much more efficient and robust than SA.

Mailing List and Forum

We have established a mailing list and forum for AutoDock users. Here is more information about the AutoDock List (ADL). URL for the forum is http://mgl.scripps.edu/forum.

What is AutoDockTools (ADT)?

We have developed and continue to improve our graphical front-end for AutoDock and AutoGrid, ADT (AutoDockTools). It runs on Linux, Mac OS X, SGI IRIX and Microsoft Windows. We also have new tutorials, along with accompanying sample files.

Where is AutoDock Used?

AutoDock has now been distributed to more than 29000 users around the world. It is being used in academic, governmental, non-profit and commercial settings. In January of 2011, a search of the ISI Citation Index showed more than 2700 publications have cited the primary AutoDock methods papers.

AutoDock is now distributed under the GPL open source license and is freely available for all to use. Because of the restrictions of incorporating GPL licensed software into other codes for the purpose of redistribution, some companies may wish to license AutoDock under a separate license agreement - which we can arrange. Please contact Prof. Arthur J. Olson at + 1 (858) 784-2526 for more information.

Why Use AutoDock?

AutoDock has been widely-used and there are many examples of its successful application in the literature (see References); in 2006, AutoDock was the most cited docking software. It is very fast, provides high quality predictions of ligand conformations, and good correlations between predicted inhibition constants and experimental ones. AutoDock has also been shown to be useful in blind docking, where the location of the binding site is not known. Plus, AutoDock is free software and version 4 is distributed under the GNU General Public License; it easy to obtain, too.

Run Your AutoDock Research Project on World Community Grid!

Does your research run on AutoDock? If so, you may be eligible to benefit from World Community Grid’s free computational power to accelerate your research. AutoDock has already been “grid-enabled” by World Community Grid’s technical team and is currently being run on World Community Grid with the FightAIDS@Home project from The Scripps Research Institute and the Discover Dengue Drugs - Together project from The University of Texas Medical Branch. Please review World Community Grid’s research project criteria and contact World Community Grid if you have an idea for a project proposal or any questions.

Sumber : http://autodock.scripps.edu/ 

Hmm... what's Jmol??

Jmol [ChemPup]

Jmol merupakan 3D viewer for chemical structures yang berbasis java. Aplikasi ini gratis lho….. selain gratis aplikasi ini kompetabel dengan os windows, mac OS X dan linux/unix. Aplikasi ini bisa di download disitus resminya -> http://jmol.sourceforge.net/download/. Untuk aplikasi jmol ini tidak membutukkan persyaratan komputer yang neko-neko, yang penting komputer yang digunakan suport dengan java 1.4 keatas. Tutorial instalasi untuk masing-masing sistem operasinya bisa di lihat disitusnya.

Setelah diinstal di komputer, saatnya menggunakan aplikasi ini. Penggunaan utama aplikisi ini kan untuk melihat suatu senyawa secara tiga dimensi tetapi selain itu kita juga bisa menggambar dengan menggunakan jmol ini. Untuk melihat suatu senyawa, data base nya bisa di download di PupChem. Senyawa yang kita butuhkan bisa di peroleh dengan mudah dan gratis. Di PupChem tersebut hanya tinggal ketik nama senyawa dan di download file dengan tipe .sdf yang 3D-nya ya.

Gambar di bawah ini adalah contohnya

Jmol yang digunakan dalam sistem operasi linux (PCLinuxOS). Kalau untuk menggambar senyawa sesuai dengan keinginan yang pertama kali ada lah membuka jmol dengan tampilan polos.

Lalu pada menu tool bar nya klik pada gambar ikon “Open the model kit“

Setelah di klik muncul seperti ini deh.

Nah langsung muncul senyawa CH4. Untuk merubah senyawa ini dapat klik kanan di sembarang tempat di layar yang berwarna hitam lalu pilih ikon yang bergambar senyawa dan pilih jenis senyawanya. Digambar saya memilih senyawa CH3NO2

Nah jadi deh senyawa CH3NO2-nya. Software ini sangat berguna jika kita mempelajari tentang suatu senyawa atau kita juga dapat menggukanan aplikasi ini untuk proses belajar mengajar.

Untuk menu di dalam sebenarnya masih banyak dan Jmol dapat menggunakan suatu script. Untuk keperluan yang sederhana seperti diatas, kemampuan mengolah data sebatas menggambar itu sudah cukup untuk mengoperasikan aplikasi ini. Untuk hal yang lebih rumit kemampuan dalam bahasa pemrograman juga di butuhkan.

Selamat mencoba ya,,, Yang tidak bisa kudu di coba,,, Yang sudah bisa kudu di bagi-bagi ilmunya,,,

Sumber : http://jmol.sourceforge.net/
              http://wiki.jmol.org/index.php/Main_Page

Kegunaan Chemoffice... (Check This Out..)

Analisa dengan ChemOffice

Modifikasi Asetilkolinesterase dengan Mutasi Kombinasi Secara In Silico Untuk biosensor Organofosfat

Pengawasan lingkungan dari insektisida yang mempengaruhi kesehatan manusia dan ekosistem, telah menjadi pusat perhatian karena penggunaan insektisida di dunia. Deteksi insektisida di lingkungan dapat dilakukan dengan biosensor yang menggunakan asetilkolinesterase. Dalam penelitian ini telah dilakukan modifikasi asetilkolinesterase Torpedo californica secara in silico (simulasi komputer). Modifikasi ini bertujuan untuk meningkatkan sensitifitas dan kespesifikan terhadap organofosfat. Modifikasi asetilkolinesterase dilakukan secara in silico dengan program Modeller 6.2 dan untuk mengetahui efek modifikasi terhadap sensitifitas dan kespesifikannya digunakan program AutoDock 3.0. Strategi yang digunakan untuk memperoleh mutan yaitu dengan kombinasi mutan tunggal yang diharapkan dapat meningkatkan sensitifitas enzim terhadap organofosfat. Dalam penelitian ini tidak dapat diperoleh asetilkolinesterase yang lebih sensitif dan spesifik terhadap organofosfat. Kesulitan prediksi efek mutasi terhadap inhibisi organofosfat terjadi karena adanya dua model pengikatan organofosfat yang dipengaruhi oleh konsentrasi.

Pengawasan lingkungan dari insektisida yang mempengaruhi manusia dan ekosistem, telah menjadi pusat perhatian. Organofosfat dan karbamat merupakan insektisida yang banyak digunakan dan memiliki kemampuan untuk menggantikan organoklorin seperti DDT, aldrin, lindane, dan lain-lain. Insektisida ini memiliki persistansi lingkungan yang rendah dibanding organoklorin, tetapi memiliki tingkat keracunan yang lebih tinggi.

Preparasi Ligand dan Protein

Ligand dibuat menggunakan ChemOffice 2000. Pertama, struktur 2D ligand digambar dengan ChemDraw Ultra (modul ChemOffice 2000). Kemudian, struktur 2D diekspor ke struktur 3D dengan Chem3D, struktur 3D diminimalisasi energinya dengan teori PM3 dalam MOPAC 7 (modul ChemOffice 2000). Struktur mutan dan wild type Torpedo c. dibuat dengan mutasi virtual dari pemodelan homologi.

Pemodelan Homologi

Struktur X-ray tunggal digunakan sebagai template untuk pemodelan homologi. Struktur X-ray diperoleh dari protein data bank (E105). Data struktur dimanipulasi menggunakan MODELLER 6.2 yang terdapat pada TRITON 3.0. MODELLER mengimplementasikan pendekatan pemodelan menggunakan perbandingan struktur protein. (Sali et al., 1993).8 Pemodelan dimulai dengan penataan sequence yang akan dimodelkan (target) dengan struktur protein tiga dimensi yang telah diketahui (cetakan). Setelah itu dilakukan penghitungan batasan pada sequence target yang dihitung dari penataannya dengan struktur tiga dimensi template. Batasan tersebut diperoleh dari analisis statistik hubungan pasangan-pasangan protein homolog. Analisis ini berdasar pada database penataan 105 famili yangtermasuk 416 protein yang telah diketahui strukrur tiga dimensinya.

Pengaruh modifikasi asetilkolinesterase terhadap inhibisi organofosfat tidak dapat diprediksi menggunakan AutoDock 3.0 karena organofosfat memiliki dua model pengikatan, yaitu pengikatan ligand pada sisi periperal dan sisi aktif serin. Oleh sebab itu perlu dilakukan penelitian lebih lanjut untuk mempelajari mekanisme inhibisi organofosfat. Mutan yang spesifik untuk karbamat yaitu mutan F330A. Mutan F330A memiliki konstanta inhibisi satu setengah kali lebih besar dibanding dengan asetilkolinesterase wild type. Dari hasil penelitian ini perlu dilakukan eksperimen lebih lanjut untuk memperoleh asetilkolinesterase yang lebih spesifik dan sensitif untuk karbamat, yaitu dengan subtitusi residu F330A.

Sumber : http://industri10stefany.blog.mercubuana.ac.id/category/ringkasan-jurnal/

JChemPaint (ChemPup)

JChemPaint [ChemPup]

JChemPaint (or JCP for short here) is the editor and viewer for 2D chemical structures developed using CDK. It is implemented in several forms: a Java application and two varieties of Java applet.

JChemPaint Editor applet

• An applet is a Java program that runs only within a web page.
• The JCP Editor allows the user to draw chemical structures, and to import and export structure data in plain-text formats (SMILES, Molfile, CML)
• It also allows to programmatically load and display a chemical structure, which can then be edited by the user.

For demonstration, the Steinbeck group (EBI) hosts various releases of the applet. You can try the stable relase there, or preview the development version.

A snapshot of the 3.0 release applet is given below: 

 

To learn how to insert and use the applet within a web page, see JChemPaint Inside Webpages.  

JChemPaint Viewer applet

• (An applet is a Java program that runs only within a web page.)
• The JCP Viewer only allows to programmatically display a chemical structure, which the user cannot modify.
• Demo page  

To learn how to insert and use the applet within a web page, see JChemPaint Inside Webpages. 

JChemPaint application

• The application is a stand-alone program. It needs an installed Java Virtual Machine for operation. If your system does not have a JVM, get it from Sun's Java website.
• The JCP application has all the functionality of the JCP Editor applet (see below), plus file input and output.

Below a screenshot of the 3.0 release: 

 

Features

These are the most prominent capabilities of the application; most of them are also available in the applets.

• Drawing and deletion of single, double, triple and stereo bonds.
• Ring templates (3-8 atoms) with one-click attachment.
• An extensive template library.
• Colouring of atom types, and other rendering settings.
• Editing of atomic charges, isotopes and hydrogen count.
• Loading and saving of structures in Chemical Markup Language (CML) and as MDL MOL files and SDF files (loading only).
• Automated Structure Layout, also known as Structure Diagram Generation.
• Loading structures from the Internet using CAS or NSC number.
• Normalization of structures, currently limited to aromaticity detection.
• Saving bitmap pictures of the structures.
• Saving structures as graphics (PNG, BMP, Scalable Vector Graphics (SVG)).
• Postscript printing. 

In some aspects JChemPaint is different from other 2D editors:

• JChemPaint is open source and free software. We believe that scientific software, especially when its development was publicly funded, should be free. As the GNU people put it: «`Free software´ is a matter of liberty, not price. To understand the concept, you should think of `free speech´, not `free beer´». Everyone can participate in the development of the program. Everyone can download and change the source code, provided that they make the changes publicly available again, according to the GNU Lesser General Public License, LGPL. This ensures that the community can take advantage of any bugfix or enhancement made to the system. It also ensures that a scientist, who needs a standard piece of software like a structure editor as a helper application in his/her new program, does not have to reinvent the wheel over and over again because all the structure editors that have been written before are now proprietary software. If there is a free structure editor, he/she can focus on the real science.
• JChemPaint is in constant development and you can help (see below).
• Since JChemPaint is written in Java, it runs on any computing platform and operating system for which a Java Virtual Machine (of version >= 1.3 up to JCP 2.4 and version >= 1.5 for JCP > 2.4) has been implemented (like Linux, Windows, Solaris, AIX and others).
• JChemPaint is available free of charge.
• JChemPaint is translated into several languages: Dutch, French, German, Polish, Portuguese and Spanish. 

Source :  http://sourceforge.net/apps/mediawiki/cdk/index.php?title=JChemPaint

ChemTOOL (Chempup)

ChemTool [ChemPup]

ChemTool sesungguhnya hanyalah sebuah file spreadsheet yang dirancang untuk penkonversian massa zat ke mol dan sebaliknya. Chemtool ini merupakan salah satu applet yang ada dalam Chempup seperti yang saya tulis di ChemPup, Applet Kimia pada Puppy Linux. Sangat sederhana namun cukup inspiratif. Ini tentu masih dapat dikembangkan lebih lanjut untuk pembuatan kalkulator khusus hanya dengan menggunakan spreadsheet. Saya sudah coba mengalihbahasakan ChemTool ini.

Ini adalah bentuk aslinya.

 

Berikutnya adalah hasil terjemahan dengan tidak mengubah rumus yang ada di dalam-nya.

 

Kalau berminat (meskipun tidak begitu penting) silahkan unduh dari sini (file xlsx) 13,5 KB.

Saya kira file ini akan dikembangkan lebih lanjut, sebab sudah banyak yang menggunakan spreadsheet untuk digunakan dalam pengajaran kimia seperti yang saya tulis di blog ini: Mengembangkan Simulasi Matematika untuk Kimia dengan Excel.

Semoga bermanfaat.

Sumber : http://urip.wordpress.com/2011/06/08/chemtool-pengkonversi-mol-dan-massa-zat-dari-chempup/

GElement (ChemPup)

GElement [ChemPup]

GElement sebenarnya merupakan aplikasi yang dapat dipasang pada setiap sistem operasi Linux. Menurut saya GElement atau dengan nama sedikit beda GElemental namun tampilannya lebih bagus.

Tapi kali ini saya membahasannya setelah saya mencoba menggunakan ChemPup dalam Puppy Linux. Seperti halnya aplikasi yang menyajikan tabel periodik tentu akan memberikan informasi sedatail mungkin dengan tampilan yang sangat menarik. Tak terlalu banyak lebih-nya pada aplikasi yang satu ini.

Pada GElement ini kita bisa melihat properti terkait unsur masing-masing mulai dari informasi yang tergolong umum, sifat fisik, maupun sifat atomiknya.

Dari tabel ini kita juga bisa menelusuri lebih lanjut mengenai sumber yang dijadikan patokan pemberian nilai-nilai variabel sifat.

Berikut ini adalah screenshoot tampilan GElement model list, bukan dalam bentuk tabel seperti yang terlihat pada gambar-gambar sebelumnya. Kita bisa mengurutkan berdasarkan header tabel list yang ada juga bisa melihat sifat berdasarkan sifat umum (general), sejarah, sifat fisik, sifat termal, sifat atomik, bentuk kristalografik, elektronik dan sebagainya.

 

Aplikasi ini sangat cocok digunakan mengajarkan materi yang terkait sengan sistem periodik, struktur atom dan kimia unsur.

Meskipun saya belum mendapatkan yang dapat dipasang di sistem operasi windows, softaware serupa sudah banyak tersedia, baik dalam bentuk flash maupun web atau yang harus diinstall terlebih dahulu.

Selamat menjelajah.

Sumber : http://urip.wordpress.com/2011/06/08/gelement-tabel-periodik-unsur-yang-memberi-banyak-informasi/

Linux Live USB Versi Kimia

Linux Live USB Creator Versi Kimia

Dengan semakin banyak dan berkembangnya Sistem Operasi Linux, terutama banyaknya distro Linux gratis yang bisa kita gunakan seperti Ubuntu, Kubuntu, Fedora, PCLinuxOS dan lainnya, mungkin membuat sebagian yang belum pernah mencoba penasaran. Bagi pengguna Windows, ada alternatif untuk mencoba tanpa harus install di komputer, dengan menggunakan USB Flashdisk saja.

Sebelumnya saya juga pernah mengulas tentang Membuat Bootable Linux dalam USB Flashdisk dengan software UNetBootin. Kini ada alternatif software lain yang lebih mudah dan juga mempunyai beberapa kelabihan lain, yaitu Linux Live USB Creator ( disingkat LiLi ).

Linux Live USB Creator mendukung berbagai distro Linux. Selain bisa membuat bootable USB Linux, dengan Lili ini, kita juga bisa membuat Linux langsung berjalan di windows tanpa harus booting. Dibanding UNetBootin, penggunaannya juga lebih mudah.

5 Langkah Mudah !!

Untuk membuat Bootable Linux dalam USB, software ini memberikan 5 langkah mudah. Ketika menjalankan pertama kali, langsung tampil ke-5 langkah ini dengan penjelasan yang mudah diikuti. Berikut tampilan awal program ini :

Langkah-langkahnya sebagai berikut:

1)  Pilih USB Flashdisk yang akan di isi dengan Linux, USB harus dengan Format FAT atau FAT32. Jika USB sudah FAT atau FAT32, kita tidak perlu mem-formatnya.

2)    Langkah ini adalah memilih sumber distro Linux, bisa dari CD-ROM, file ISO yang sudah ada di hardisk atau jika kita punya koneksi internet yang cepat, pilih Download (langsung do wnload dari internet)

3)  PERSISTENCE, merupakan pengaturan besarnya space USB yang akan digunakan untuk menyimpan data, konfigurasi yang kita ubah atau jika kita nanti ingin menginstall software tambahan di linux USB ini. Jika ini tidak di isi ( 0 MB), maka Linux di USB tetap bisa dijalankan, tetapi perubahan data di linux tidak akan tersimpan. Serta kita tidak bisa menyimpan data di linux dan menginstall software tambahan lain.

4)     Langkah 4 ini ada 3 pilihan : yang pertama apakah file-file yang diuat akan di sembunyikan (hidden), kedua apakah USB akan di format ( semua data akan hilang) dan ketiga untuk membuat versi portable di windows (perlu koneksi internet)

5)  Langkah terkhir adalah CREATE, klik icon halilintar warna kuning untuk mulai proses pembuatan. Sebelumnya kita bisa mengatur opsi tambahan dengan klik tombol OPTIONS.

Setelah langkah 5 selesai, maka USB kita sudah berisi Linux dan siap kita coba. Restart komputer dan atur BIOS agar booting pertama kali membaca USB Flashdisk. Bagaimana mengatur BIOS agar Komputer Booting dari USB Flashdisk ? . Untuk memperjelas, berikut langkah pengaturan dengan BIOS Phoenix dan AMI, agar komputer booting pertama kali membaca USB Flashdisk:

1)     Pasang USB Flasdisk yang berisi sistem yang akan dijalankan di komputer (PC) atau laptop

2)    Hidupkan komputer jika belum menyala, jika komputer masih hidup, Restart terlebih dahulu.

3)  Ketika muncul pesan atau tulisan awal, biasanya ada informasi tekan tombol tertentu untuk masuk ke BIOS atau System Utilities. Bisa tekan beberapa kali untuk memastikan. Berikut contoh beberapa pesan yang sering muncul:


                  >> Press DEL to enter BIOS setup ( berarti kita tekan tombol Delete, di hampir                              sebagian besar PC)

>> Press F2 for System Utilities ( Berarti kita tekan tombol F2, misanya : di laptop/netbook )

>> Di beberapa PC/Laptop, mungkin dengan tombol yang berbeda, pastika untuk memeriksa pesan awal yang tampil.

4)      Setelah kita masuk ke BIOS (seperti tampilan dibawah ini), kita bisa mulai mengatur urutan proses booting

1)     Cari Menu BOOT, jika tidak ada, cari di menu lain yang didalamnya ada keterangan seperti : Boot, Booting, Boot Order, Boot Priority dan sebagainya.

6)  Jika USB Flashdisk sudah dipasang dan BIOS juga mendukung pengenalan USB, seharusnya akan tampil seperti berikut:

Untuk BIOS tertentu, seperti misalnya AMI BIOS, hanya ada 1st Boot dan 2nd Boot, sehingga mungkin USB Flashdisk tidak akan langsung tampil di pilihan/urutan booting.

.

     Maka perlu di cek di pilihan lain, masih di menu utama BOOT, disini adalah Hard Disk Drives. Pastikan USB Flashdisk dipindahkan di urutan pertama.

1)      Selanjutnya ubah agar Flahsdisk berada di urutan pertama di urutan booting ( biasanya ada keterangan Boot Priority Order, Boot Device Priority dan sejenisnya)

8) Setelah selesai, lihat menu Exit dan Pilih menu Exit Saving Changes atau Save Changes and Exit.

1)      Pengaturan akan tersimpan dan komputer akan restart, selanjutnya komputer pertama kali akan membaca USB Flashdisk.

Jika flashdisk sudah dimasukkan tetapi tidak terdeteksi, ada beberapa kemungkinan, seperti: BIOS belum mendukung teknologi untuk mendeteksi USB sebagai media booting. Kemungkinan kedua adalah Flashdisknya mengalami kerusakan atau perlu di set agar USB Flashdisk dideteksi sebagai Hard drives, seperti contoh di atas. Untuk sebab pertama mungkin bisa diatasi dengan Update (Upgrade BIOS),

Di beberapa BIOS mungkin pengaturannya tidak sama persis dengan yang dicontohkan diatas, tetapi intinya sama, mengatur urutan Booting di BIOS. Jika kita tidak memerlukan booting dari USB Flashdisk lagi, sebaiknya pengaturan di kembalikan ke keadaan sebelumnya

Penjelasan tentang PERSISTENCE

Dengan adanya fitur Persistence, setelah kita booting dan menjalankan linux, maka segala perubahan (setting) atau penambahan file bisa tersimpan di USB. Kita juga bisa menginstall software di linux dan software ini akan tersimpan meski kita restart komputer atau booting ulang.

Jika Persistence ini di isi 0 MB, maka perubahan setting atau data di linux (misalnya mengubah theme/tampilan, wallpaper dsb) akan hilang ketika kita menjalankan ulang Linux di USB. Dan sampai artikel ini ditulis, jika kita menjalankan Linux USB ini secara langsung dari windows ( dengan VirtualBox ), maka fitur Persistence belum bekerja.

Membuat Versi Portable di Windows

Di langkah ke 4 terdapat pilihan untuk membuat Linux bisa langsung dijalankan di windows tanpa harus booting. Tetapi jika ini dipilih, installasi akan memerlukan koneksi internet untuk download software tambahan, yaitu VirtualBox ( besarnya sekitar 68 MB). Dengan koneksi yang terbatas, tentu ini akan merepotkan, apalagi jika belum selesai tetapi proses pembuatan gagal di tengah jalan. Alternatifnya, jika ingin membuat versi Windows, kita bisa download VirtualBox secara terpisah dari link yang sudah disediakan ( Download Portable Virtual Box - 68 MB)

Selanjutnya Extract (atau buka virtual box) dan letakkan semuanya di USB yang sudah berisi linux yang sudah dibuat. Setelah di extract ke USB akan ada folder bernama VirtualBox. Selanjutnya kita tinggal membuka folder ini dan menjalankan file Virtualize_This_Key.exe.

Download:


Linux Live USB Creator Versi Installer
Linux Live USB Creator Versi Portable




Informasi selengkapnya silahkan mengunjungi Linux Live USB

Sumber : http://ebsoft.web.id/mencoba-linux-di-windows-dengan-linux-live-usb-creator/